Từ năm 2009 đến nay, Bộ đội Biên phòng Đắk Lắk đã xây dựng và đưa vào hoạt động 3 phòng khám quân dân y kết hợp, phối hợp cùng chính quyền và các đơn vị tổ chức hàng nghìn buổi khám chữa bệnh, cấp phát thuốc miễn phí cho người dân, cơ bản kiểm soát một số dịch bệnh như sốt xuất huyết, sốt rét, nâng cao sức khỏe nhân dân, củng cố vững chắc thế trận lòng dân suốt tuyến biên giới...