Hoạt động từ cuối năm 1989, chợ Na Mèo ban đầu chỉ là khu chợ nhỏ lẻ của đồng bào Thái ở bản Na Mèo, xã Na Mèo, huyện Quan Sơn, tỉnh Thanh Hóa. Từ khi cửa khẩu Na Mèo được nâng cấp lên thành cửa khẩu quốc tế, chợ Na Mèo trở nên nhộn nhịp, hàng hóa đa dạng và lượng người giao thương ngày càng đông vui, nhộn nhịp. Đây được gọi là chợ hữu nghị bởi không chỉ là nơi giao thương, mà còn là nơi gặp gỡ, giao lưu của bà con các bản ở hai bên Việt Nam và Lào trên đoạn biên giới khu vực cửa khẩu Na Mèo.