Cùng hàng loạt giá trị văn hóa kiến trúc độc đáo, chùa Vạn Niên với lịch sử hơn 1000 năm tuổi, đến nay vẫn nguyên vẹn như thuở ban đầu xây dựng, chính là minh chứng cho đời sống văn hóa tinh thần sinh động của nhân dân ta. Ngôi cổ tự này đã trở thành một bảo tàng gìn giữ phát huy tín ngưỡng thờ phật, thờ mẫu cổ truyền của dân tộc trong dòng chảy văn hóa tâm linh tại mảnh đất Thăng Long xưa, Thủ đô Hà Nội ngày nay.