Theo Thông tư dự kiến của Bộ Công Thương, các doanh nghiệp đầu mối sẽ tự xác định giá bán lẻ đối với sữa và thực phẩm chức năng do mình cung ứng và thực hiện việc kê khai (trong trường hợp không áp dụng biện pháp bình ổn giá) hoặc đăng ký giá đối với mặt hàng sữa (trong trường hợp áp dụng biện pháp bình ổn giá) với Bộ Công Thương, đồng thời thông báo hệ thống phân phối của mình với Bộ Công Thương. Sau khi xem xét tính phù hợp của mức giá đăng ký hoặc kê khai, Bộ Công Thương sẽ thông báo mức giá nêu trên và thông tin về hệ thống phân phối của từng doanh nghiệp, hợp tác xã đầu mối đến cơ quan quản lý tại các địa phương để phối hợp giám sát giá ở khâu bán lẻ cuối cùng. Từ đầu năm 2017, việc quản lý giá sữa cho trẻ em dưới 6 tuổi đã được chuyển giao từ Bộ Tài chính sang Bộ Công Thương. Theo báo cáo của Sở Công Thương Hà Nội, trong 2 tháng đầu năm, cơ quan này đã tiếp nhận bàn giao danh sách các doanh nghiệp sản xuất, nhập khẩu sản phẩm sữa dành cho trẻ em dưới 6 tuổi, mức giá các doanh nghiệp đã đăng ký, kê khai từ Sở Tài chính.