Là đơn vị đầu ngành chống khủng bố toàn quân, những năm gần đây, Binh chủng Đặc công tập trung hiện đại hóa mọi mặt trong huấn luyện lực lượng chống khủng bố, bao gồm: cải tiến, nâng cao chất lượng giáo trình, đào tạo cán bộ huấn luyện, xây dựng thao trường đạt chuẩn, cũng như trang bị nhiều vũ khí đặc chủng hiện đại. Ghi nhận công tác huấn luyện nhiệm vụ chống khủng bố ở Lữ đoàn đặc công bộ 113 và Lữ đoàn 429.