Là đơn vị đi đầu toàn quân triển khai nghiên cứu trên ba lĩnh vực khoa học công nghệ có tính đột phá là công nghệ tích hợp vũ khí trên tàu hải quân, công nghệ tiêu từ tàu quân sự và công nghệ thủy âm, chỉ trong hai năm trở lại đây, Viện Kỹ thuật Hải quân đã thực hiện hàng trăm đề tài, dự án, nhiệm vụ chuyên môn bảo đảm tiến độ và chất lượng, trong đó, có tới 75% đề tài nhiệm vụ Viện thực hiện có độ khó, ứng dụng công nghệ cao. Để làm được điều này, Viện Kỹ thuật Hải quân đã phải đi trước đón đầu các công nghệ cao, hiện đại, nhằm xây dựng quân chủng cách mạng, chính quy, tinh nhuệ và hiện đại.